Aqui unas diferencias entre linux y windows
*Linux es Case Sensitive
Que quiere decir esto, que en linux puedes tener MiArchivo.txt miarchivo.txt o MIARCHIVO.TXT en un mismo directorio y seran completamente diferentes
*Linux no identifica las particiones mediante caracteres
Simplemente en linux las particiones estan dentro del arbol del sistema, a diferencia de windows que los identifica con una letra, por ejemplo en windows el floppy es la unidad A, en linux es /media/floppy (normalmente)
*Linux no tiene *.EXE
En windows se identifica un ejecuatable por la extencion exe, en linux un ejecutable se identica por sus permisos
*El entorno grafico no es parte del OS.
Puedes instalar linux sin un entorno grafico (si!! consola) y esto se debe a que el entorno grafico en linux es un "lujo" ya que puedes hacer todo (configuracion) desde la consola si hablamos de un servidor, pero para una estacion de trabajo puedes seleccionar los diferentes entornos graficos como xfce, gnome, kde, etc.
*EL administrador se llama root
En linux solo hay una cuenta de administrador, claro, este puede delegar tareas a otros usuarios
Linux a diferencia de Windows, es multitarea real, y multiusuario, posee un esquema de seguridad basado en usuarios y permisos de lectura, escritura y ejecución establecidos a los archivos y directorios. Esto significa que cada usuario es propietario de sus archivos, y otro usuario no puede acceder a estos archivos. Esta propiedad no permite el contagio de virus entre archivos de diferentes usuarios.
Una diferencia, quizás la más importante de todas, con respecto a cualquier sistema operativo comercial, es el hecho de que es software libre, qué quiere decir esto? que junto con el sistema, se puede obtener el código fuente de cualquier parte del mismo y modificarlo a gusto. Ésto da varias ventajas, por ejemplo:
1. La seguridad de saber qué hace un programa tan solo viendo el código fuente, o en su defecto, tener la seguridad que al estar el código disponible, nadie va a agregar «características ocultas» en los programas que distribuye.
2. La libertad que provee la licencia GPL permite a cualquier programador modificar y mejorar cualquier parte del sistema, ésto da como resultado que la calidad del software incluido en GNU/Linux sea muy buena.
3. El hecho de que el sistema sea mantenido por una gran comunidad de programadores y usuarios alrededor del mundo, provee una gran velocidad de respuesta ante errores de programas que se van descubriendo, que ninguna compañía comercial de software puede igualar.
Además de las ventajas anteriormente enumeradas, GNU/Linux es ideal para su utilización en un ambiente de trabajo, dos razones justifican ésto:
1. Al ser software libre, no existe el costo de las licencias, y una copia del sistema GNU/Linux puede instalarse en tantas computadoras como se necesite.
2. Existen utilidades para el trabajo en oficina, que son compatibles con las herramientas de la serie MS-Office.